Новости и мнения

Топ 7 в эволюционной биологии

Снимок наиболее высоко оцененных статей в эволюционной биологии и смежных областях, с факультета 1000

1 и 4. Накопление метилирования ДНК

Два исследования посвящены накоплению изменений метилирования ДНК в линиях растений Arabidopsis thaliana в течение 30 поколений. Результаты демонстрируют частоту новых наследственных изменений метилирования, которые были как минимум в 1000 раз выше, чем ожидаемая частота мутаций ДНК. Такие различия в паттернах метилирования могут влиять на транскрипцию и морфологию, вызывая фенотипическое разнообразие в отсутствие генетических мутаций.

RJ Schmitz и др., «Трансгенерационная эпигенетическая нестабильность является источником новых вариантов метилирования», Science , 334: 369-73, 2011. Free F1000 Evaluation

C. Becker et al., «Спонтанные эпигенетические вариации в метиломе Arabidopsis thaliana», Nature , doi: 10.1038 / nature10555, 2011. Свободная оценка F1000

2. Бактериальная ДНК для хозяина

Как конъюгативное разделение ДНК между бактериями, так и [не знаю] перенос бактериальной ДНК в эукариотические клетки-хозяева – явление, продемонстрированное только в одной бактерии, растительном патогене под названием Agrobacterium tumefaciens, – опосредуются бактериальными системами секреции типа IV (T4SS ). Здесь исследователи идентифицируют еще один T4SS-опосредованный перенос ДНК от бактерий к хозяину, в данном случае бактериальный патоген человека Bartonella henselae в клетки человека, что может иметь значение для разработки векторов доставки генов для вакцин на основе ДНК или генной терапии.

G. Schröder et al., «Конъюгативный перенос ДНК в клетки человека с помощью системы секреции VirB / VirD4 типа IV бактериального патогена Bartonella henselae », Proc Natl Acad Sci , 108: 14643-48, 2011. Free F1000 Evaluation

3. Кто лучший секвенсор?

Сборка 1 – это соревнование по сборке генома, в котором команды из всех основных центров секвенирования демонстрируют точность своих конвейеров в задаче сборки – последовательности геномов двух вымышленных видов. В конкурсе приняли участие 41 сборка из 17 групп по всему миру. В то время как результаты продемонстрировали высокий уровень охвата и точности, записи, которые процветали в одной категории, часто страдали от низкого качества в других категориях, что говорит о том, что есть место для улучшения по всем направлениям.

D. Earl et al., «Сборка 1: Конкурентная оценка методов сборки de novo short read», Genome Res , ISSN 1088-9051 / 11, 2011. Бесплатная оценка F1000

5. Бактериальное омоложение

Вопрос о возрасте бактерий обсуждается с 2005 года, когда исследователи впервые предложили это сделать. Новая модель пересматривает более ранние эксперименты и предполагает, что старение, возможно, развилось рано как механизм, который защищает новые поколения от ущерба, нанесенного родителем.

CU Rang et al., «Временная динамика бактериального старения и омоложения», Current Biology , 21: 1813-36, 2011. Free F1000 Evaluation

6. Выявлены наиболее распространенные гены

Анализ 10 миллионов кодирующих белок генов и генных меток из секвенированных бактерий, архей, эукариот, вирусов и метагеномов показывает, что гены, кодирующие транспозазы – ферменты, которые катализируют перемещение мобильных, переносимых элементов в другую часть генома, – являются наиболее распространенный в природе. Результаты показывают, что транспозазы выгодны для их организмов-хозяев и поддерживаются их мобильной природой, которая стимулирует их распространение внутри и между геномами.

RK Aziz и соавт., «Транспозазы являются наиболее распространенными, наиболее распространенными генами в природе», Nucleic Acids Res , 38: 4207-17, 2010. Free F1000 Evaluation

7. Добра и зла человеческой эволюции

Анализируя три геномных набора данных по всему геному от европейских людей и выполняя эволюционное моделирование, исследователи обнаруживают, что по сравнению с другими организмами, такими как дрозофила , люди испытали менее положительный отбор по всему виду, при этом слабо вредные мутации приводили к значительным изменениям генома.

К. Э. Ломюллер и др., «Естественный отбор влияет на множество аспектов генетической изменчивости в предположительно нейтральных участках человеческого генома», PLoS Genetics , 7: e1002326, 2011. Бесплатная оценка F1000

F1000 Top 7 – это снимок статей с самым высоким рейтингом за 30-дневный период на Факультете 1000 эволюционной биологии, рассчитанный 28 ноября 2011 года. Члены факультета оценивают и оценивают наиболее важные статьи в своей области. Чтобы увидеть последние рейтинги, выполнить поиск в базе данных и прочитать ежедневные оценки, посетите сайт http://f1000.com .

Обсуждение

Ваш e-mail не будет опубликован. Обязательные поля помечены *